Protein–RNA interactions for Protein: Q99JZ0

Sdcbp2, Syntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdcbp2Q99JZ0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Sdcbp2Q99JZ0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms