Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
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Ctu1Q99J10 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
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Ctu1Q99J10 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Ctu1Q99J10 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Ctu1Q99J10 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Ctu1Q99J10 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Ctu1Q99J10 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Ctu1Q99J10 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Ctu1Q99J10 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Ctu1Q99J10 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctu1Q99J10 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms