Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Cldn16Q925N4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Cldn16Q925N4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn16Q925N4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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