Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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PdgfdQ925I7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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PdgfdQ925I7 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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PdgfdQ925I7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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PdgfdQ925I7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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PdgfdQ925I7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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PdgfdQ925I7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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PdgfdQ925I7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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PdgfdQ925I7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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PdgfdQ925I7 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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PdgfdQ925I7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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PdgfdQ925I7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PdgfdQ925I7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PdgfdQ925I7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PdgfdQ925I7 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PdgfdQ925I7 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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PdgfdQ925I7 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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