Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms