Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atl3Q91YH5 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atl3Q91YH5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atl3Q91YH5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atl3Q91YH5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atl3Q91YH5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Atl3Q91YH5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Atl3Q91YH5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atl3Q91YH5 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atl3Q91YH5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atl3Q91YH5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atl3Q91YH5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atl3Q91YH5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atl3Q91YH5 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atl3Q91YH5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atl3Q91YH5 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atl3Q91YH5 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atl3Q91YH5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atl3Q91YH5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atl3Q91YH5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atl3Q91YH5 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atl3Q91YH5 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atl3Q91YH5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atl3Q91YH5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atl3Q91YH5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atl3Q91YH5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atl3Q91YH5 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atl3Q91YH5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atl3Q91YH5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atl3Q91YH5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atl3Q91YH5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atl3Q91YH5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms