Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y07

Pcdhb12, MCG141300, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb12Q91Y07 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdhb12Q91Y07 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms