Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD6

Vps36, Vacuolar protein-sorting-associated protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps36Q91XD6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vps36Q91XD6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps36Q91XD6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps36Q91XD6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps36Q91XD6 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps36Q91XD6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps36Q91XD6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps36Q91XD6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps36Q91XD6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps36Q91XD6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps36Q91XD6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps36Q91XD6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps36Q91XD6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps36Q91XD6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps36Q91XD6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps36Q91XD6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps36Q91XD6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps36Q91XD6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps36Q91XD6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps36Q91XD6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps36Q91XD6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps36Q91XD6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps36Q91XD6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps36Q91XD6 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps36Q91XD6 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps36Q91XD6 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps36Q91XD6 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps36Q91XD6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps36Q91XD6 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps36Q91XD6 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps36Q91XD6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps36Q91XD6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps36Q91XD6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps36Q91XD6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vps36Q91XD6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vps36Q91XD6 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vps36Q91XD6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vps36Q91XD6 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vps36Q91XD6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vps36Q91XD6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vps36Q91XD6 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vps36Q91XD6 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vps36Q91XD6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms