Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1275-201ENSMUST00000099620 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.6 ms