Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cabp4Q8VHC5 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cabp4Q8VHC5 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cabp4Q8VHC5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms