Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smg8Q8VE18 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Smg8Q8VE18 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Smg8Q8VE18 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Smg8Q8VE18 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg8Q8VE18 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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