Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Stx18Q8VDS8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Stx18Q8VDS8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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