Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCQ6

Sgms1, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms1Q8VCQ6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Sgms1Q8VCQ6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgms1Q8VCQ6 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgms1Q8VCQ6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgms1Q8VCQ6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgms1Q8VCQ6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgms1Q8VCQ6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgms1Q8VCQ6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgms1Q8VCQ6 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgms1Q8VCQ6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgms1Q8VCQ6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgms1Q8VCQ6 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgms1Q8VCQ6 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgms1Q8VCQ6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgms1Q8VCQ6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgms1Q8VCQ6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgms1Q8VCQ6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgms1Q8VCQ6 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgms1Q8VCQ6 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgms1Q8VCQ6 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgms1Q8VCQ6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgms1Q8VCQ6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgms1Q8VCQ6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgms1Q8VCQ6 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgms1Q8VCQ6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms