Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ubxn4Q8VCH8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn4Q8VCH8 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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