Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1W8

Impg1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Impg1Q8R1W8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Impg1Q8R1W8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms