Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssh3Q8K330 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Ssh3Q8K330 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ssh3Q8K330 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ssh3Q8K330 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssh3Q8K330 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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