Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf39Q8K2Z2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms