Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I9

Fbxo18, F-box DNA helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo18Q8K2I9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fbxo18Q8K2I9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fbxo18Q8K2I9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxo18Q8K2I9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxo18Q8K2I9 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxo18Q8K2I9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxo18Q8K2I9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxo18Q8K2I9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxo18Q8K2I9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxo18Q8K2I9 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxo18Q8K2I9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxo18Q8K2I9 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxo18Q8K2I9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxo18Q8K2I9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxo18Q8K2I9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxo18Q8K2I9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxo18Q8K2I9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxo18Q8K2I9 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxo18Q8K2I9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxo18Q8K2I9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxo18Q8K2I9 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxo18Q8K2I9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxo18Q8K2I9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxo18Q8K2I9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fbxo18Q8K2I9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Fbxo18Q8K2I9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Fbxo18Q8K2I9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Fbxo18Q8K2I9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Fbxo18Q8K2I9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo18Q8K2I9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms