Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZK6

Trim61, MCG22896, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim61Q8JZK6 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim61Q8JZK6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms