Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LgsnQ8CIX8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms