Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms