Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef8Q8CE24 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef8Q8CE24 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef8Q8CE24 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef8Q8CE24 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef8Q8CE24 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef8Q8CE24 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef8Q8CE24 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef8Q8CE24 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef8Q8CE24 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef8Q8CE24 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef8Q8CE24 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef8Q8CE24 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Pramef8Q8CE24 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Pramef8Q8CE24 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef8Q8CE24 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Pramef8Q8CE24 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef8Q8CE24 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Pramef8Q8CE24 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Pramef8Q8CE24 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef8Q8CE24 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Pramef8Q8CE24 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Pramef8Q8CE24 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef8Q8CE24 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef8Q8CE24 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef8Q8CE24 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef8Q8CE24 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef8Q8CE24 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef8Q8CE24 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef8Q8CE24 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef8Q8CE24 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef8Q8CE24 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef8Q8CE24 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef8Q8CE24 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef8Q8CE24 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef8Q8CE24 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef8Q8CE24 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef8Q8CE24 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef8Q8CE24 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef8Q8CE24 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef8Q8CE24 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef8Q8CE24 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef8Q8CE24 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef8Q8CE24 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms