Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc87Q8CDL9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms