Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCX5

Krt222, Keratin-like protein KRT222, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt222Q8CCX5 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt222Q8CCX5 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms