Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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