Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CntrobQ8CB62 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms