Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9X6

Epc1, Enhancer of polycomb homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epc1Q8C9X6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epc1Q8C9X6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epc1Q8C9X6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Epc1Q8C9X6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epc1Q8C9X6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epc1Q8C9X6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epc1Q8C9X6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epc1Q8C9X6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epc1Q8C9X6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Epc1Q8C9X6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Epc1Q8C9X6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epc1Q8C9X6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epc1Q8C9X6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epc1Q8C9X6 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epc1Q8C9X6 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epc1Q8C9X6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epc1Q8C9X6 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epc1Q8C9X6 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epc1Q8C9X6 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epc1Q8C9X6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epc1Q8C9X6 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epc1Q8C9X6 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Epc1Q8C9X6 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epc1Q8C9X6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epc1Q8C9X6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epc1Q8C9X6 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epc1Q8C9X6 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epc1Q8C9X6 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epc1Q8C9X6 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epc1Q8C9X6 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Epc1Q8C9X6 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epc1Q8C9X6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epc1Q8C9X6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epc1Q8C9X6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epc1Q8C9X6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epc1Q8C9X6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epc1Q8C9X6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epc1Q8C9X6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epc1Q8C9X6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Epc1Q8C9X6 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epc1Q8C9X6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epc1Q8C9X6 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epc1Q8C9X6 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epc1Q8C9X6 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epc1Q8C9X6 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epc1Q8C9X6 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epc1Q8C9X6 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epc1Q8C9X6 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epc1Q8C9X6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epc1Q8C9X6 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms