Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Usp20Q8C6M1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Usp20Q8C6M1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Usp20Q8C6M1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Usp20Q8C6M1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Usp20Q8C6M1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Usp20Q8C6M1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Usp20Q8C6M1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Usp20Q8C6M1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Usp20Q8C6M1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Usp20Q8C6M1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Usp20Q8C6M1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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