Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6J9

Nlrp4b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4bQ8C6J9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp4bQ8C6J9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp4bQ8C6J9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp4bQ8C6J9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp4bQ8C6J9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp4bQ8C6J9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp4bQ8C6J9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp4bQ8C6J9 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp4bQ8C6J9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp4bQ8C6J9 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp4bQ8C6J9 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp4bQ8C6J9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp4bQ8C6J9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp4bQ8C6J9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp4bQ8C6J9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp4bQ8C6J9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms