Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ccdc187Q8C5V8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ccdc187Q8C5V8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ccdc187Q8C5V8 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ccdc187Q8C5V8 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ccdc187Q8C5V8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ccdc187Q8C5V8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ccdc187Q8C5V8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ccdc187Q8C5V8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ccdc187Q8C5V8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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