Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssuh2Q8C3L1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms