Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Atg16l1Q8C0J2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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Atg16l1Q8C0J2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Atg16l1Q8C0J2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Atg16l1Q8C0J2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Atg16l1Q8C0J2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Atg16l1Q8C0J2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Atg16l1Q8C0J2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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