Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
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Cldn17Q8BXA6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Cldn17Q8BXA6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Cldn17Q8BXA6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Cldn17Q8BXA6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Cldn17Q8BXA6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Cldn17Q8BXA6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Cldn17Q8BXA6 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Cldn17Q8BXA6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Cldn17Q8BXA6 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
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Cldn17Q8BXA6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Cldn17Q8BXA6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Cldn17Q8BXA6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Cldn17Q8BXA6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Cldn17Q8BXA6 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn17Q8BXA6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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