Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Nup54Q8BTS4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nup54Q8BTS4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nup54Q8BTS4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nup54Q8BTS4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nup54Q8BTS4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nup54Q8BTS4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nup54Q8BTS4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nup54Q8BTS4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nup54Q8BTS4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nup54Q8BTS4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nup54Q8BTS4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup54Q8BTS4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup54Q8BTS4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup54Q8BTS4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup54Q8BTS4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup54Q8BTS4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup54Q8BTS4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup54Q8BTS4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup54Q8BTS4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup54Q8BTS4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup54Q8BTS4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup54Q8BTS4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup54Q8BTS4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup54Q8BTS4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup54Q8BTS4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup54Q8BTS4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup54Q8BTS4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup54Q8BTS4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup54Q8BTS4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup54Q8BTS4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup54Q8BTS4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms