Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR07

Bicd1, Protein bicaudal D homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bicd1Q8BR07 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bicd1Q8BR07 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms