Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms