Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKN5

Tubgcp5, Gamma-tubulin complex component 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp5Q8BKN5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms