Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop53Q8BK35 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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