Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Usp1Q8BJQ2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Usp1Q8BJQ2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Usp1Q8BJQ2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Usp1Q8BJQ2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Usp1Q8BJQ2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Usp1Q8BJQ2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Usp1Q8BJQ2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Usp1Q8BJQ2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Usp1Q8BJQ2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms