Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy1Q8BIJ7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms