Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim6Q8BGE7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim6Q8BGE7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim6Q8BGE7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim6Q8BGE7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim6Q8BGE7 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim6Q8BGE7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim6Q8BGE7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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