Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG19

Tmtc4, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc4Q8BG19 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Tmtc4Q8BG19 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Tmtc4Q8BG19 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Tmtc4Q8BG19 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Tmtc4Q8BG19 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmtc4Q8BG19 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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