Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc172Q810N9 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms