Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Zbed4Q80WQ9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Zbed4Q80WQ9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Zbed4Q80WQ9 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Zbed4Q80WQ9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Zbed4Q80WQ9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Zbed4Q80WQ9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Zbed4Q80WQ9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Zbed4Q80WQ9 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Zbed4Q80WQ9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
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Zbed4Q80WQ9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms