Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Shq1Q7TMX5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms