Protein–RNA interactions for Protein: Q76N33

Stambpl1, AMSH-like protease, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stambpl1Q76N33 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stambpl1Q76N33 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stambpl1Q76N33 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stambpl1Q76N33 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stambpl1Q76N33 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stambpl1Q76N33 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stambpl1Q76N33 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stambpl1Q76N33 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stambpl1Q76N33 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stambpl1Q76N33 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Stambpl1Q76N33 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stambpl1Q76N33 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stambpl1Q76N33 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stambpl1Q76N33 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stambpl1Q76N33 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stambpl1Q76N33 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Stambpl1Q76N33 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Stambpl1Q76N33 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Stambpl1Q76N33 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Stambpl1Q76N33 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Stambpl1Q76N33 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stambpl1Q76N33 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stambpl1Q76N33 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stambpl1Q76N33 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stambpl1Q76N33 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stambpl1Q76N33 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stambpl1Q76N33 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stambpl1Q76N33 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stambpl1Q76N33 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stambpl1Q76N33 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stambpl1Q76N33 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stambpl1Q76N33 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stambpl1Q76N33 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stambpl1Q76N33 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stambpl1Q76N33 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stambpl1Q76N33 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms