Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mindy1Q76LS9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms