Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pcp4l1Q6W8Q3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms