Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Atp8b3Q6UQ17 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Atp8b3Q6UQ17 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms