Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms